1986年7月，经国务院学位委员会批准，中国林科院获得林业经济管理学科硕士学位授权专业，2006年，该学科被列为国家林业局重点学科。2010年，中国林科院获批农林经济管理一级学科硕士学位授权专业。截至2013年，中国林科院在农林经济管理一级学科下，设置了林业经济管理、林业与区域发展两个招生专业。农林经济管理一级学科主要依托科信所进行管理，包括研究生的招生、培养等。

截至2023年3月，本所共有21人被批准为研究生导师。博士生导师：侯元兆、李智勇、陈绍志、陈幸良、何友均、徐斌、吴水荣、赵荣；硕士生导师：施昆山、侯元兆、李智勇、陈绍志、陆文明、李忠魁、李维长、王登举、孟永庆、王忠明、樊宝敏、李剑泉、何友均、吴水荣、徐斌、陈勇、胡延杰、赵荣、张德成、赵晓迪。

本所从1997年开始招收硕士研究生，从2000年开始招收博士研究生。截至2023年3月，共招收硕士研究生134人，其中已毕业104人，在读31人；招收博士研究生53人，其中已毕业35人，在读18人；接收博士后研究人员26人，已出站24人，在站2人。